약물연구관련 사이트

첫 포스팅에서는 약물 연구에사용되는 데이터베이스들을 소개하려고합니다.

 

우리 정보학하는 사람들이 중요해진 이유는

 

최근 10~20년동안 사람들이 데이터생성만 미친듯이 해서 데이터들이 많이 쌓이게 되죠. (앞으로도 쌓일겁니다.)

 

그래서 이러한 데이터들을 효율적으로 정리하고, 새로운 결과를 내는 것이 중요하게 되었기 때문입니다.

 

 

 저는 정보학하는 사람들을 하이에나 라고 생각합니다.  하이에나 하면 비열하고 더럽다. 라는 인식이 강하겠지만

 

  여기저기 다니면서 부패한 고기들을 정리하는 역활을 하기 때문에 생태계순환에 비중있는 역활을 하게됩니다.

 

부패한 고기처리에 어느정도 일조하는거죠.

 

 앞으로도 정보학하는 사람들을 필요하게 될 것이고, 회사에 한사람 정도는 필수적으로 있어야할 직업일 것 같습니다.

 

(회사에 모아둔 자료정리에 꼭 필요하겠죠 ㅎㅎ)

 

뿌잉뿌잉

본론으로 들어갑시다!

 

 

약물연구 관련 사이트는 다음과 같습니다.

 

GDSC

www.cancerrxgene.org/

Home page - Cancerrxgene - Genomics of Drug Sensitivity in Cancer

CCLE

portals.broadinstitute.org/ccle

Broad Institute Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE)

NCI-60

dtp.cancer.gov/discovery_development/nci-60/

Discovery & Development Services | Developmental Therapeutics Program (DTP)

CTRP

portals.broadinstitute.org/ctrp.v2.1/

Cancer Therapeutics Response Portal

CMAP

clue.io/

https://clue.io/

LINCS

www.lincsproject.org/

NIH LINCS Program

 

database name	description
GDSC	Cancer Cell line을 이용하여 약물을 실험한 결과를 공유 이외에 mRNA, Methylation, CNV, mutation etc를 공개함
CCLE	GDSC와 비슷한 데이터베이스 더 다양한 데이터를 공유함
NCI-60	GDSC,CCLE와 비슷한 데이터베이스입니다.
CMAP	질병끼리의 연관성, 치료에 대한 연관성 분석 데이터베이스
LINCS	약물과 Expression사이 관계를 분석한 데이터베이스

 

cMAP, LINCS의 경우 약물 관련 분석에 아주 중요한 역활을 하는 데이터베이스입니다. (그러나 저는 지금 배우는 중이라 내용을 잘 안봤네요..ㅎㅎ)

 

이것 이외에도 약물관련 사이트들은 drugbank, Chemmbl, Zinc등이 있습니다. 이놈들은 약물에 대한 정보들 혹은 살수있는 곳을 알수있습니다.

 

 

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