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기본적인 개념/실험개념2

[실험기본] primer 디자인 (제작) 오늘은 primer제작에 대해서 이야기 하려고 합니다. primer 디자인하는 것은 BI로서는 조금 생소 할수도 있을 것 같습니다. (BI 대부분 컴돌이라서.. ?) 그래도 만약 소규모 렙이나 회사에 간다면 이런것 즈음 간단하게 알아 주면 괜찮겠죠? 프라이머 제작을 하는 이유는 여러가지가 있겠지만, 저는 Sanger sequencing(생어 시퀀싱)을 하기 위한 프라이머 제작을 몇번 해보았습니다. (프라이머 제작은 아마 다 비슷하지 않을까요?) 일단 그전에 생어 시퀀싱을 하는 이유에 대해서 이야기 해보자면 NGS, Genotype array 분석에서 분석자들이 찾은 변이가 그 위치에 실제 있는지 확인차 하는 것입니다. 프라이머를 제작하기 위해서는 필요한 것이 당연히 확인 해야할(하고싶은) 시퀀스죠! 확인.. 2020. 6. 29.
[실험기본] DNA 분리방법 Bioinformatics를 주로 하다보면 실험적인 개념이 모자랄 때가 있다. 이번에 소개할 내용은 DNA 분리시에 알아둬야할 개념들을 정리하였다. 조직, 모근 구강 상피세포, 배양된 세포 및 혈액 등으로 부터 Genomic DNA분리 가능함. 많은 양의 유전체 시료가 필요할 때는 사람의 경우 B세포를 Epstein -Barr virus (EBV)로 감염시켜서 불멸화(Immortalized) 를 유도한다. 그리고 Lymphoblastoid cell line (LCLs)를 만들어서 사용하고 있다. 그러나 이러한 방법은 불멸화유도과정 혹은 배양과정에서 새로운변이가 생길 수 있는 문제점이 있다. * EBV의 경우 lymphoma, carcinoma와도 연관이 있음. 헤르페스 바이러스라고 생각하면됨.(1) 최근.. 2020. 6. 15.