데이터베이스 소개2 [DB소개] Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) Cell line이란 간단하게 우리몸의 세포를 일부 떼어내어 조직을 길러낸 것을 말합니다. 이러한 Cell line을 만드는 이유는 어떠한 질병에 대해 연구를 할때 사람을 대상으로 연구가 이루어 질때 많은 어려움들이 있습니다. 예를들어 세포에 자극을 주고 반응을 본다던지, 혹은 일정경과를 지낸 후에 세포가 어떻게 변화하는지에 대해서 알고싶은 경우가 있습니다. 이럴때 실제 사람으로 하게되면 윤리적으로 문제가 발생이 됩니다. 또한 어떠한 특이한 질병을 갖는 환자들에 대해서도 실제 실험을 하게되면 환자의 목숨을 위협할 수가 있고, 또한 소중한 연구데이터가 사라질 수도 있습니다. (사람 목숨을 연구재료로만 생각하는 뜻이 아닙니다.) 이러한 단점들을 해결하고자 연구자들은 환자들의 환부에 있는 세포를 떼어내어 배양.. 2021. 4. 5. [DB소개] GDC, GDC legacy 데이터 베이스 간단 설명 TCGA는 의료 Bioinformatics를 할때 필수적으로 다뤄야 하는 데이터입니다. 예전에는 TCGA site만 따로 있었는데 요즘은 GDC로 변경해서 여러 데이터가 합쳐져 다루고 있습니다. (Game Developers Conference아님, Genomic Data Commons Data Portal입니다.) 미국에서 진행한 여러 빅 스터디들을 모아둔 곳이 GDC입니다. raw 데이터의 경우 병원장 승인을 받고 (연구계획서 제출도 해야됨) 허가가 나오면 들어가서 만질 수가 있고 일반적인 사람들이 만질 수 있는 데이터는 데이터 처리된 결과물을 이용할 수가 있습니다. GDC portal이외에도 GDC legacy도 있습니다. 여기는 옛날 데이터를 저장해놓은 데이터 베이스고 여기서 나중에 포스팅할 CC.. 2021. 4. 2. 이전 1 다음
