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ECFP2

[약물] ECFP fingerprints 간단한 정리 약물의 fingerprint 중에 topological fingerprint는 약물의 유사도나 substructure 를 검색하기 위하여 개발이 되었습니다. 그중에서 많이 사용하는 방법중 하나가 바로 ECFP입니다. 약물의 유사도의 경우 설명을 하지 않아도 우리가 비슷한 약물이 비슷한 짓을 할것이다 라고 생각하기 때문에 유사성을 보려는 시도를 예전부터 많이 하였습니다. ECFP는 2010년에 Rogers, David, and Mathew Hahn. "Extended-connectivity fingerprints." Journal of chemical information and modeling 50.5 (2010): 742-754. 라는 논문에서 처음 나왔습니다. 논문에서 나온 ECFP 만드는 과정은 다.. 2021. 3. 24.
[약물] chemical fingerprint, ECFP (Extened Connectivity FingerPrint) - drug repositioning, drug discovery 오늘 포스팅할 내용은 ECFP라는 개념에 대해서 설명하고자 합니다. 먼저 알아둬야할 개념은 fingerprint인데, fingerprint란? 무엇일까요? 영어 사전에 찾아보면 "지문"이라고 나옵니다. 지문의 가장 큰 특징은 사람마다 다르다는 특징이 있습니다. 사람마다 다르기 때문에 최근에는 휴대폰의 잠금해체에도 이용되고 있죠. 사람들마다 지문이 같을 확률은 10억분의 1정도라고 합니다. (네이버 지식인에서 급하게 찾아왔어요!ㅎㅎ) 이처럼 fingerprint의 뜻은 지문이기도 하지만 비슷하게 여러 뜻(digital fingerprint (전자 개인정보), genetic fingerprint (유전자 지문) 등)으로도 사용이 됩니다. 그렇다면 Chemical에서의 fingerprint는?! 무슨 뜻일까요.. 2020. 12. 9.