FAM1 [GWAS] plink input format (형식확인) plink를 설치를 했으면, 설치폴더에 toy라는 파일들이 보입니다. toy.ped, toy.map 이렇게 두 파일의 경우 기본적인 plink input file format입니다. 샘플수가 많을경우 binary파일로 바꿔줘야하는데, 그렇게 바꾼 파일의 경우 뒤에 .bed,.bim,.fam 가 붙습니다. 기본적인 format에서 binary파일로 변환을 시킬수가 있는데 그러면 그 폴더 내에 toy_step1.bim, .bed, .fam이 생기게 됩니다. 우선 기본적인 input format을 확인해봅시다. vi*로 아무 toy파일로 들어가게되면 두 줄이 보인다. vi = 리눅스에서 터미널을 통해 텍스트를 읽어 올 수 있다. 용량이 많을 경우 느리게 반응함. 그럴때는 less -S 을 이용함. vi와 le.. 2020. 6. 5. 이전 1 다음
