GSVA1 [R] ssgsea 의 scoring방법을 실습을 통해 이해해 보기 1. ssgsea 간단 설명 ssgsea는 single sample gene set enrichment analysis 의 약자입니다. GSEA 라는 분석의 경우 두 그룹간의 발현값들을 비교하여 결과를 내는 방식인 반면(GSEA 계산하는 방법도 추후에 알아보고 올리도록 하겠습니다.) ssgsea의 경우 각 샘플 내에서 원하는 Gene set이 얼만큼 발현이 되었는지에 대해서 확인할 수가 있습니다. 계산을 어떻게 하는지 궁금해서 찾아봤는데, ssgsea의 경우 다음 연구에서 처음 사용이 되었습니다. https://www.nature.com/articles/nature08460#online-methods 2. ssgsea의 계산 방법 위에 그림에나오는 부분이 ssgsea의 식입니다. 저도 수학 전공이 아니다.. 2022. 4. 11. 이전 1 다음
