chisq.test1 [R,GWAS] 카이검정 (chisq.test), 피셔검정(fisher.test) 쉽게 하기 GWAS분석 툴인 Plink를 사용하면 흔하게 볼 수 있는 Header는 CHISQ입니다. 카이 검정이라고 하는 이 CHISQ는 R에서도 쉽게 확인할 수가 있습니다. 카이 검정이나 피셔 검정의 목적은 내가 분석할 데이터들이 실측값 예측값을 이용하여 실측값들이 모집단(예측값)에 맞다.에 대한 오류가 있을 확률을 구하는 것입니다. 영가설 : 예측값들이 실측값과 비슷하다. 큰차이가 나지 않을 것이다. 대립가설 : 예측값들이 실측값과 다르다. 큰차이가 날 것이다. 두 집단이 동일한지 확인 (GWAS에서 plink에서 이용) 영가설 : 두 집단이 비슷할 것이다. 대립가설 : 두 집단이 다를 것이다. 두 개 이상의 변수가 독립성을 띄는지 아닌지 확인 영가설 : 두 집단이 독립적일 것이다. 대립가설 : 두 집단이 독.. 2021. 3. 9. 이전 1 다음