rcdk2 [R] rcdk설치시 오류 해결방법 환경은 다음과 같습니다. version : Ubuntu 20.04 1LTS R version : 4.0.3 rcdk를 이용하기 위해서 설치를 하니 다음과 같은 오류가 떳습니다. configure: error: One or more Java configuration variables are not set. Make sure R is configured with full Java support (including JDK). Run R CMD javareconf as root to add Java support to R. If you don't have root privileges, run R CMD javareconf -e to set all Java-related variables and then inst.. 2021. 1. 29. [약물] 약물의 유사도 확인하기, ECFP 실습, R package이용 이전에 포스팅하였던 내용인 약물의 ECFP를 계산하고 tanimoto coefficient 유사도를 찾는 실습을 해보고자 합니다. R을 이용한 분석이고 추후에 python에 대한 분석도 올릴 예정입니다. 패키지로는 Rcpi, rcdk package를 이용하겠습니다. 최근 ChemmineR package가 나오긴 했지만, 주로 많이 사용하는 package를 사용하도록 하겠습니다. (ChemmineR에는 ECFP 계산하는게 없는것 같네요..) 참고로 rcdk는 install.packages 를 이용하면되고, Rcpi의 경우 Bioconductor를 이용(BiocManager::install)해서 설치를 해야합니다. 그리고 주의점은 rcdk, Rcpi의 경우 뭔가 설치하는데 예민한것 같습니다.(설치가 쉽지가 .. 2020. 12. 10. 이전 1 다음
