[면역항암제] HLA 명명법

 

HLA 명명법에 대해서 간단하게 소개하고자 합니다. (뭐 영어 사이트 해석이라고 생각하시면될 것 같네요)

 

HLA gene family는 chr6번에서 주로 위치해있습니다.

 

출처 : wikipeia "Human leukocyte antigen"

 

HLA란? 면역반응과정에 필요한 것 중에 하나로 항원과 만나서 pMHC로 되면서 면역반응을 촉진시킨다라고 생각하시면 될 것 같습니다. 

* pMHC? : peptide-Major Histocompatibility Complex 의 약자입니다.

 

HLA-A,B,C의 경우  class I이고  DR, DQ, DP의 경우 class II 라고 아시면 됩니다. 

 

이렇게 class를 두개로 나눈 이유도 각 class마다 작용되는 것도 다릅니다. (추후 정리하겠습니다.)

 

간단하게 설명을 하면 class I은 T-Cell, class II의 경우 APC (종류 : 대식세포 b-cell, dendritic cell , APC : Antigen Presenting Cell)

 

본격적으로 HLA의 명명 법에 대해서 설명하도록 하겠습니다.

 

원문은 다음과 같습니다.

http://hla.alleles.org/nomenclature/naming.html

HLA Nomenclature @ hla.alleles.org

 

원문에 나오는 사진을 인용하자면

 

출처 : http://hla.alleles.org/nomenclature/naming.html

간단하게 HLA-A*가 기본입니다.

 

그리고 다음 *뒤로는 HLA의 종류를 나타낼 수가 있습니다. 콜론을 기준으로 4개로 나누어 집니다.

 

대체적으로 HLA는 이렇게 4개의 digit으로 나누어지고 추가적인 정보나 이름은 필요시에 명명합니다.

 

1번째 Field : 안티바디 종류에 따라 그룹을 나눈 부분

2번째 Field : sequence에 의해 변이로 subtype이 나눠진 경우

3번째 Field : coding지역에서의 synonymous 변이에 의한 차이가 날 경우 (non-coding substitutions, silent와 같은)

4번째 Field : non-coding지역에서의 변화 5', 3' - UTR에서 변이(flank the exons and introns)가 일어날 경우

 

flank exon은 exon주변 구역을 이야기함.

 

추가로 마지막 부분에 문자가 들어가는데, 발현에 대한 정보들입니다.

 

N인 경우 : 실제 발현이 안됨.

L인 경우 : 정상과 비교했을때 Low로 발현

S인 경우 : 가용성으로 발현되는 단백질의 대립유전자를 표현할때 사용함. 

(원문 : The 'S' suffix is used to denote an allele specifying a protein which is expressed as a soluble, 'Secreted' molecule but is not present on the cell surface.)

C인 경우 : 세포표면이 아니라 세포질에서 나타나는 단백질을 생성하는 경우

A인 경우 : 실제 단백질의 발현이 되는지 의심되는 경우

Q인 경우 : 변이가 다른 대립유전자의 정상발현에 영향을 준다고 알려질 경우.

 

2017년 기준 C, A는 없다고 알려져 있습니다.

 

여기까지가 HLA명명법을 정리한 내용이었습니다.

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현재 공부중이라 공부하는 대로 바로 올리도록 하겠습니다. 혹시 다른 부분이 있으면 의견 남겨주세요!