format merge1 [GWAS] plink 유용한 기능 (1) (exclude, extract) plink QC를 공부하기 전에 plink에서 유용한 기능들을 다루어 보도록하겠습니다. QC는 그냥 default로 사용하는 -hwe 0.00001로 진행하고 --Geno 0.05 이런식으로는 알려드릴수 있으나, 그러면 공부하는 의미가 없죠! 그렇기 때문에 조금만 더 찾아 본 후에 포스팅 하도록 하겠습니다. plink에 유용한 기능이 생각보다 많습니다. 초창기 plink 공부할 때, plink 사이트 들어가자마자, 원하는 기능들만 쏙 빼고 창을 닫았습니다. (물박사 종특ㅎㅎㅎㅎㅎㅎ) 왜냐하면, 영어로 된것들 다 읽기 귀찮았거든요... ㅎㅎㅎㅎㅎㅎㅎ 추후에 샘플들을 추가하거나, 혹은 분석한 것이 맞는지 확인을 할 때, 결국 다시 plink에 제가 필요한 기능들이 대부분 있더군요. 오늘 포스팅할 내용은 pl.. 2020. 6. 9. 이전 1 다음