single cell analysis1 [seurat] single cell 분석 시에 umap이 다르게 나오는 경우. single cell 분석시에 가장 흔하게 사용되는 분석 도구가 R에 Seurat package입니다. 최근 분석을 하면서 Umap의 결과가 달라질 수 있다는 말을 들었습니다(tsne의 경우 매 분석마다 다르기 때문에 rds로 저장을 해주셔야 합니다.) 이 부분에 대해서 찾아보니 OS별로 혹은 컴퓨터 별로 발생이 될수가 있다고 이야기하고 있습니다(random seed를 고정해도 문제가 발생됩니다.). 분석할때 참고하시면 좋을 것 같습니다. https://stackoverflow.com/questions/67101829/seurat-umap-visualization-result-is-mirrored-after-running-in-two-identical-envi Seurat UMAP visualizatio.. 2022. 5. 23. 이전 1 다음