예쁘게 그리기1 [R] pheatmap으로 예쁜 heatmap 그리기 Expression 연구를 하다가 보면 많이 사용하는 그림이 heatmap입니다. heatmap의 대표적인 용도는 보여주기식(우리가 발현한 유전자들이 대략 그림처럼 cluster가 되어있다!!)이 강합니다. 뭔가 두 그룹이 다르다는 것을 t.test pvalue이외에도 사람들이 알기 쉽게 하기 위해서는 이러한 heatmap이 필요합니다. heatmap은 기본적인 heatmap, gplots package에 heatmap.2 기능이 있습니다. 그리고 사람들이 많이 사용하는 ggplot2에서도 만들 수가 있구요. 그러나 오늘은 아주 예쁘게 heatmap을 만들기 위해 주로 사용하는 pheatmap(pretty heatmap)에 대해 실습을 하고자 합니다. UCSC XENA 데이터를 이용하여 분석을 할 것입니.. 2021. 1. 29. 이전 1 다음
