어떤 분석이든 간에 가장 중요한 것은 표현이다. 표현은 곧 그림!
GWAS분석을 하면서 유용하게 사용하였던 그림 그리기 기능을 알려준 사이트들을 소개합니다.
Q-Q plot : https://genome.sph.umich.edu/wiki/Code_Sample:_Generating_QQ_Plots_in_R
Code Sample: Generating QQ Plots in R - Genome Analysis Wiki
Quantile-quantile plots (qq-plots) can be useful for verifying that a set of values come from a certain distribution. For example in a genome-wide association study, we expect that most of the SNPs we are testing not to be associated with the disease. Unde
genome.sph.umich.edu
manhattan plot : https://genome.sph.umich.edu/wiki/Code_Sample:_Generating_Manhattan_Plots_in_R
Code Sample: Generating Manhattan Plots in R - Genome Analysis Wiki
A useful way to summarize genome-wide association data is with a Manhattan plot. This type of plot has a point for every SNP or location tested with the position in the genome along the x-axis and the -log10 p-value on the y-axis. Credit This page is based
genome.sph.umich.edu
계속 생각나는데로 추가하도록 하겠습니다.
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